Kurzbeschreibung

Das Molekularmechanik-Programm Gromacs bietet umfangreiche Möglichkeiten zur Berechnung chemischer und physikalischer Eigenschaften sehr großer molekularer Systeme. Aufgrund sehr schneller Kraftfeld-basierter Methoden können mit Gromacs sehr große Systeme bestehnd aus mehreren tausend bis hin zu Millionen von Atomen simuliert werden. Viele statistischen und thermodynamischen Eigenschaften können aus den Simulationen abgeleitet werden. Im Gegensatz zu quantenchemischen Methoden steht jedoch die elektronische Wellenfunktion nicht zur Verfügung.

Helpdesk

Mo - Fr 8 - 18 Uhr
+49 (0)731/50-30000
helpdesk(at)uni-ulm.de
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Service-Points des kiz

Verfügbarkeit an der Universität Ulm

Zielsystem/Zielgruppe	Verfügbarkeit
kiz CUSS Cluster (Solaris)	Nein
kiz CUSS Cluster (Linux)	Nein
kiz Linux Pools	Nein
kiz Windows Pools	Nein
bwGRiD Cluster Ulm	Ja, nach Laden des entsprechenden Moduls
Uniweiter Lizenzzugriff	Ja, die Software kann kostenlos heruntergeladen werden
Externer Lizenzzugriff	Ja, die Software kann kostenlos heruntergeladen werden
Softwarebezug Studierende	Ja, die Software kann kostenlos heruntergeladen werden
Softwarebezug Mitarbeiter	Ja, die Software kann kostenlos heruntergeladen werden

Nutzungsbedingungen und Lizenzvereinbarungen

Das Programm Gromacs steht under der General Public License (GPL) und kann daher von jedem kostenlos verwendet werden.

Bitte zitieren Sie in Ihren Veröffentlichungen Gromacs gemäß der Vorgabe, die Sie auf der Gromacs Webseite finden.

Uniweiter Lizenzzugriff und Softwarebezug

Sie können Gromacs kostenlos im Bereich "Download" der Gromacs Webseite herunterladen. Dort finden Sie auch eine Installationsanleitung.

Weiterführende Dokumentation

Im Bereich "Documentation" der Gromacs Webseite finden Sie eine ausführliche Dokumentation zu Gromacs.

Zugriff auf Software (nur bwGRiD)

Gromcas ist zur Zeit nur auf den Rechnern des bwGRiD-Ulm verfügbar. Sie können dort mittels des Befehls

module load chem/gromcas

Zugriff auf das Programm erhalten. Per Default wird zur Zeit die Version 4.0.3 geladen. Alle verfügbaren Gromacs-Versionen werden von dem Befehl

module avail chem/gromacs

angezeigt. Detaillierte Hilfe und Beispiele für das Queueing-System erhalten Sie mittels des Befehls

module help chem/gromacs

Bitte lesen Sie den Modul-Hilfetext bevor Sie Gromacs verwenden.

Support

Bitte wenden Sie sich an unseren Softwaresupport, wenn Sie weitergehende Hilfe benötigen.