Kurzbeschreibung

Das Programm Jmol ist ein sehr umfangreiches Java-Paket zur Darstellung molekularer Daten. Jmol kann 3D Darstellungen von Atompositionen anzeigen. Darüber hinaus kann Jmol auch Isoflächen von Elektronendichten und Orbitalen darstellen. Jmol kann mehr als 50 verschiedene Chemie-Datenformate lesen, u.a. ABINIT, ACES, ADF, Castep, CIF, CML, GAMESS, Gaussian,  Ghemical, Jaguar, MDL molfile, Molpro, NWChem, PDB, VASP, Wien2k, XYZ.

Helpdesk

Kontaktzeiten Mo - Fr  8 - 18 Uhr
Telefon +49 (0)731/50-30000
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Service-Points des kiz

Verfügbarkeit an der Universität Ulm

Zielsystem/ZielgruppeVerfügbarkeit
kiz CUSS Cluster (Solaris) Ja, nach Laden des entsprechenden Moduls
kiz CUSS Cluster (Linux)Ja, nach Laden des entsprechenden Moduls
kiz Linux PoolsJa, nach Laden des entsprechenden Moduls
kiz Windows PoolsNein
bwGRiD Cluster UlmJa, nach Laden des entsprechenden Moduls
Uniweiter LizenzzugriffJa, Software kann kostenlos heruntergeladen werden
Externer LizenzzugriffJa, Software kann kostenlos heruntergeladen werden
Softwarebezug StudierendeJa, Software kann kostenlos heruntergeladen werden
Softwarebezug MitarbeiterJa, Software kann kostenlos heruntergeladen werden

Nutzungsbedingungen und Lizenzvereinbarungen

Jmol ist unter der LGPL (GNU Lesser General Public License) lizensiert und kann daher von jedem kostenlos verwendet werden.

Weiterführende Dokumentation

Der Bereich "Documentation" der Jmol Webseite enthält ausführliche Dokumente zu Jmol.

Uniweiter Lizenzzugriff und Softwarebezug

Sie können das Programm kostenlos im Bereich "Download" der Jmol Webseite herunterladen. Der Download Bereich enthält auch eine Installationsanleitung.

Zugriff auf Software (CUSS-Cluster, Linux-Pools und bwGRiD)

Auf dem Rechnern des CUSS Compute Clusters (Linux und Solaris), auf den Linux Pool Computern und auf den Rechnern des bwGRiD-Ulm können Sie mittels des Befehls

module load chem/jmol

Zugriff auf die aktuelle Version des Programms Jmol erhalten.  Nach dem Laden können Sie mit

jmol

das Programm starten. Wenn Sie sich remote (z.B. per ssh) eingeloggt haben, muss X-Forwarding aktiviert sein.

Bitte lesen Sie den Modul-Hilfetext bevor Sie Jmol verwenden. Diese ausführliche Hilfe erhalten Sie mittels des Befehls

module help chem/jmol

Alle verfügbaren Jmol-Versionen werden von dem Befehl

module avail chem/jmol

angezeigt.

Support

Bitte wenden Sie sich an unseren Softwaresupport, wenn Sie weitergehende Hilfe benötigen.