Kurzbeschreibung

Das Programm VMD ist ein sehr umfangreiches Paket zur Darstellung molekularer Daten. Die Stärke von VMD liegen bei sehr großen Systemen mit tausenden von Atomen und Trajektorien. Darüber hinaus kann VMD auch Isoflächen von Elektronendichten und Orbitalen darstellen. VMD kann die Dateien von mehr als 50 verschiedenen Chemieprogrammen lesen, u.a. AMBER, CHARMM, CPMD, GAMESS, Gaussian Cube, Gromacs, LAMMPS, NAMD, NetCDF, PDB, VASP.

Helpdesk

Kontaktzeiten Mo - Fr  8 - 18 Uhr
Telefon +49 (0)731/50-30000
Öffnet ein Fenster zum Versenden einer E-Mailhelpdesk(at)uni-ulm.de
Web-Formular für Anfragen
[mehr]

Service-Points des kiz

Verfügbarkeit an der Universität Ulm

Zielsystem/ZielgruppeVerfügbarkeit
kiz CUSS Cluster (Solaris) Nein
kiz CUSS Cluster (Linux)Ja, nach Laden des entsprechenden Moduls
kiz Linux PoolsJa, nach Laden des entsprechenden Moduls
kiz Windows PoolsNein
bwGRiD Cluster UlmJa, nach Laden des entsprechenden Moduls
Uniweiter LizenzzugriffJa, Software kann nach Registrierung kostenlos heruntergeladen werden
Externer LizenzzugriffJa, Software kann nach Registrierung kostenlos heruntergeladen werden
Softwarebezug StudierendeJa, Software kann nach Registrierung kostenlos heruntergeladen werden
Softwarebezug MitarbeiterJa, Software kann nach Registrierung kostenlos heruntergeladen werden

Nutzungsbedingungen und Lizenzvereinbarungen

Die VMD Lizenz erlaubt eine kostenlose Nutzung im Rahmen von Forschung und Lehre.

Uniweiter Lizenzzugriff und Softwarebezug

Nach Registrierung können Sie das Programm kostenlos im Bereich "Download" der VMD Webseite herunterladen. Der Bereich "Downloads" enthällt auch eine Installationsanleitung.

Weiterführende Dokumentation

Der Bereich "VMD Manuals" der VMD Webseite enthält ausführliche Dokumente zu VMD.

Zugriff auf Software (CUSS-Linux-Cluster, Linux-Pools und bwGRiD)

Auf dem Rechnern des CUSS Compute Clusters (Linux only), auf den Linux Pool Computern und auf den Rechnern des bwGRiD-Ulm können Sie mittels des Befehls

module load chem/vmd

Zugriff auf die aktuelle Version des Programms VMD erhalten. Per Default wird zur Zeit VMD 1.9 geladen. Nach dem Laden können Sie mit

vmd

das Programm starten. Wenn Sie sich remote (z.B. per ssh) eingeloggt haben, muss X-Forwarding aktiviert sein.

Alle verfügbaren VMD-Versionen werden von dem Befehl

module avail chem/vmd

angezeigt. Eine ausführliche Hilfe erhalten Sie mittels des Befehls

module help chem/vmd

Bitte lesen Sie den Modul-Hilfetext bevor Sie VMD verwenden.

Support

Bitte wenden Sie sich an unseren Softwaresupport, wenn Sie weitergehende Hilfe benötigen.