Kurzbeschreibung

Das Programm Molekel ist ein umfangreiches Paket zur Darstellung molekularer Daten. Molekel kann 3D Visualisierungen von Atompositionen, Elektronendichten und Orbitalen darstellen. Molekel kann viele verschiedene Chemie-Datenformate lesen, z.B. Gaussian, GAMESS, Jaguar, Mopac, NWChem, PDB, Q-Chem, ADF, TurboMole, XYZ, Zindo.

Bitte beachten Sie, dass der Anbieter von Molekel die Software nicht mehr weiter entwickelt (Stand 2010-2016).

Kommunikations- und Informationszentrum (kiz)

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Verfügbarkeit an der Universität Ulm

Zielsystem/ZielgruppeVerfügbarkeit
bwUniCluster (Karlsruhe) Nein
bwForCluster JUSTUS (Ulm)Nein
kiz CUSS Linux Cluster (Ulm)Ja, nach Laden des Softwaremoduls
kiz Linux Pools (Ulm)Ja, nach Laden des Softwaremoduls
kiz Windows Pools (Ulm)Nein
Uni-Ulm-weiter LizenzzugriffJa, siehe Download-Bereich der oben genannten Webseite
Externer LizenzzugriffJa, siehe Download-Bereich der oben genannten Webseite
Softwarebezug StudierendeJa, siehe Download-Bereich der oben genannten Webseite
Softwarebezug MitarbeiterJa, siehe Download-Bereich der oben genannten Webseite

Nutzungsbedingungen und Lizenzvereinbarungen

Molekel ist unter der GPL (General Public License) lizensiert und kann daher von jedem kostenlos verwendet werden.

Uniweiter Lizenzzugriff und Softwarebezug

Sie können das Programm kostenlos im Bereich "Download" der oben genannten Molekel Webseite herunterladen. Die Installationsanleitung finden Sie im "Documentation" Bereich der Webseite.

Weiterführende Dokumentation

Der Bereich "Documentation/Manual" der oben verlinkten Molekel Webseite enthält eine ausführliche Dokumente zu Molekel.

Zugriff auf Software (oben genannte Cluster und Linux Pools)

Auf dem Rechnern der oben genannten Cluster und Linux Pools können Sie mittels des Befehls

module load vis/molekel

Zugriff auf die aktuelle Version des Programms Molekel erhalten. Per Default wird zur Zeit Molekel 5.4.0 geladen. Nach dem Laden können Sie mit

molekel

das Programm starten. Wenn Sie sich remote (z.B. per ssh) eingeloggt haben, muss X-Forwarding aktiviert sein.

Alle verfügbaren Molekel-Versionen werden von dem Befehl

module avail vis/molekel

angezeigt. Eine ausführliche Hilfe erhalten Sie mittels des Befehls

module help vis/molekel

Bitte lesen Sie den Modul-Hilfetext bevor Sie Molekel verwenden.

Support

Bitte wenden Sie sich an unseren Softwaresupport, wenn Sie weitergehende Hilfe benötigen.