Software im Chemie-Computer-Labor

Das Chemie-Computer-Labor wird unter dem LINUX-Betriebssystem openSUSE 10.3 betrieben. Zusätzlich zur Standard KIZ Software Installation, zum Beispiel

• Standardpakete openSUSE 10.3 incl. open Office
• KDE und GNOME Desktops (Benutzeroberflächen)
• Staroffice (Officepaket)
• Maple (Computeralgebra)
• Mathlab (Datenanalyse- und Visualisierunsgsystem)
• Mathematica (Computeralgebra)
• Pgi (Portland Group Compiler Suite)
• NAG C- und FORTRAN Bibliotheken

stehen folgende chemiespezifische Software zur Verfügung:

Chemiefachinformation und Datenbank:

• Cambridge Structural Database (Spende der Dr. Barbara Mez-Starck-Stiftung Freiburg): Datenbank zu organischen und metallorganischen Kristallen
• Mercury 2.0 (Kristallvisualisierungen)
• Vista 2.1 (Spreadsheet-Programm zur statistischen Analyse von Kristalldaten)
• IsoStar (Modul der Cambridge Structural Database zu intermolekularen Wechselwirkungen, u.a. in Proteinkristallen)

Computational Chemistry, Molecular Modeling und Visualisierung

• Gaussian 03 (Programmpaket für quantenchemische Berechnungen) 
• GaussView 4.1.2  (graphisches Frontend zu Gaussian 03)
• Molpro 2006.1
• Orca 2.6.35 (für aperiodische Systeme)
• Dacapo 2.7.7 (für periodische Systeme) 

Wichtiger Hinweis zur Nutzung des Windows-Images:

Die Windows-Umgebung des Chemie-Computer-Labors ist unabhängig von den Windows-Pool-Rechnern des KIZ. Benutzerprofile und "Eigene Dateien" der KIZ-Windows-Rechner stehen NICHT zur Verfügung!

Für typische Windows-Anwendungen nutzen Sie bitte die Windows-Pools.

Die virtuelle Windows-Umgebung im Chemie-Computer-Labor ist für chemiespezifische Anwendungen vorgesehen!

Das Kommando zum Start der virtuellen Windows-Umgebeung lautet "vwin" und muss in einem Konsole-Fenster unter KDE oder Gnome eingegeben werden. Alle weiteren Erkläungen und Benutzerhilfen werden dann durch das Programm "vwin" übernommen.

Unter dem Emulationsprogramm VirtualBox 1.5.6 können folgende Windows-Programme genutzt werden

Chemiefachinformation und Datenbanken:

• ScFinder Scholar 2007 für Recherchen in den Chemical Abstracts Datenbanken
• CrossFire Commander 7.2 für Recherchen in den Datenbanken BEILSTEIN und Gmelin
• Autonom Standard (Nomenklaturprogramm für die organische Chemie, als Modul des CrossFire Commanders)
• Zugriff auf weitere Chemiedatenbanken im Internet über Internet-Explorer

Computational Chemistry

• Material Studio 5.5 (Startlizenz durch Spende der Dr. Barbara-Mez-Starck-Stiftung Freiburg/Br.) (Programmpaket für molekül- und quantenmechanische Simulationen periodischer und aperiodischer Systeme)

ChemBioOffice Ultra 2008 (weltweit führendes Programmpaket für chemische Desktop-Anwendungen):

• ChemBioDraw Ultra 11 (chemisches und biologisches Zeichnen einschl. Prognosetools für H- und ¹³C-NMR, physikochemische Eigenschaften etc.)
• ChemBio3D Ultra 11 (Programmpaket zur 3D-Modellierung, Visualisierung und Analyse mit MM- und MOPAC-Programmen sowie Interfaces zu quantenchemischen Programmen)
• ChemFinder Ultra 11 (Datenbankmanagementsystem mit Modul zur Strukturrecherche in Word- und Excel-Dateien)

NMR-Spektroskopie:

• MestRec 4.9.9 (Bearbeitung experimenteller NMR-Spektren)