Dr.-Ing. David Kracht

Research Interests

  • Signalprocessing and Communications systems
  • Machine-Learning, Inference, Fourier transform on general discrete fields
  • Boolean networks, Systems and Inference
  • Bioinformation Theory, Bioinformatics
  • Barcodes for Next Generation Sequencing

Own Theses

Dissertation (Doctoral Dissertation), Universiät Ulm, 04/2016
„Innovative Barcode-Konzepte für DNA-Sequenzierverfahren der zweiten Generation“
Open Access Repositorium der Universität Ulm http://dx.doi.org/10.18725/OPARU-3983

Diplomarbeit (Diploma Thesis), Universiät Ulm, 06/2010
„Rekonstruktion Boolscher Netzwerke mittels Fourieranalyse auf Basis von beobachteten Systemzuständen“

Studienarbeit (Semester Thesis), Universität Ulm, 04/2009
„Einsatz von Modellwissen bei der Katheterrekonstruktion: Robuste Postionsbestimmung der Katheterspitze und Klassifikation des Kathetertyps."

Teaching

SS14: Betreuung Praktikum Nachrichtentechnik
WS13/14: Betreuung Praktikum Nachrichtentechnik
SS13: Konzeption/Aufbau Praktikum Nachrichtentechnik
WS12/13: Signale und Systeme (Übung)
WS11/12: Signale und Systeme (Übung)
SS11: Informations- und Systemtheorie in den Lebenswissenschaften (Übung)

Publications

Innovative Barcode-Konzepte für DNA-Sequenzierverfahren der zweiten Generation.
David Kracht, Open Access Repositorium der Universität Ulm. Dissertation; Text; http://dx.doi.org/10.18725/OPARU-3983 (2016)

Insertion and deletion correcting DNA barcodes based on watermarks.
David Kracht, Steffen Schober.  BMC Bioinformatics 16: 50 (2015)

Using the Davey-MacKay code construction for barcodes in DNA sequencing.
David Kracht, Steffen Schober. 8th International Symposium on Turbo Codes and Iterative Information Processing (ISTC), Bremen, Germany (2014)

Canalizing Boolean Functions Maximize Mutual Information.
Johannes Klotz, David Kracht, Martin Bossert, Steffen Schober, IEEE Transactions on Information Theory 60(4): 2139-2147 (2014)

Canalizing Boolean Functions Maximize the Mutual Information. 
Johannes Klotz, David Kracht, Martin Bossert, Steffen Schober. 9th International ITG Conference on Systems, Communications and Coding (SCC), Munich, Germany, (2013)

Inferring Boolean functions via higher-order correlations.
David Kracht, M. Maucher, S. Schober, M. Bossert, H. Kestler. Computational Statistics, (2012)

Detecting controlling nodes of boolean regulatory networks.
S. Schober, David Kracht, R. Heckel, and M. Bossert. EURASIP Journal on Bioinformatics & Systems Biology, (2011)

Spectral properties of a Boolean model of the E.coli genetic network and its implication on network inference.
S. Schober, R. Heckel, and David Kracht. Proceedings of 7th International Workshop on Computational Systems Biology (WCSB) – Luxembourg (2010)

Alumni