Die Leistungen der CUMP umfassen dabei alle Schritte proteomischer Studien. Von der Konzeptionierung, über die experimentelle Planung bis hin zu praktischen Anwendungstipps erfahren sie eine ausführliche Beratung durch die Mitarbeiter der CUMP. Mit der SDS-PAGE und SCX-Chromatographie stehen potente Methoden zur Probenfraktionierung zur Verfügung. Bei der massenspektrometrischen Analyse können verschiedene Fragmentierungstechniken (CID, HCD, MSA) eingesetzt werden.

Zur Datenauswertung und statistischen Analyse steht eine Vielzahl unterschiedlicher Programme und Lösungen zur Verfügung. Die in der CUMP etablierten Methoden und Technologien ermöglichen die Bearbeitung eines breiten Spektrum biologischer und medizinischer Fragestellungen. Dabei können sowohl komplizierte qualitative als auch quantitative Analysen unter Einsatz aller gängigen Methoden (Label-frei, SILAC, isobare Reagenzien) durchgeführt werden.