Kurzbeschreibung
Das Quantenchemie-Programm Turbomole bietet umfangreiche Möglichkeiten zur Berechnung chemischer und physikalischer Eigenschaften von Atomen und Molekülen. Es können Geometrien, Vibrationsfrequenzen, Übergangsbarrieren, Anregungs- und Bindungsenergieen, und viele andere Größen berechnet werden. Dabei stehen eine Vielzahl an Methoden, Näherungen und Basissätzen zur Verfügung. Aus den Rechnungen ergeben sich auch 3D-Daten wie etwa Elektronendichten oder Molekülorbitale. Eine der Stärken von Turbomole liegt im Erkennen und Nutzen von Molekül-Symmetrien.
Das Programm TmoleX ist die zu Turbomole passende grafische Benutzeroberfläche. Neben der 3D-Visualisierung von Geometrieen oder Orbitalen kann man mit TmoleX auch Turbomole-Jobs (Input-Dateien) erstellen.
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Verfügbarkeit an der Universität Ulm
| Zielsystem/Zielgruppe | Verfügbarkeit |
| bwUniCluster (Karlsruhe) | Ja, nach dem Laden des entsprechenden Softwaremoduls |
| bwForCluster JUSTUS (Ulm) | Ja, nach dem Laden des entsprechenden Softwaremoduls |
| kiz CUSS Linux Cluster (Ulm) | Ja, nach dem Laden des entsprechenden Softwaremoduls |
| kiz Linux Pools (Ulm) | Ja, nach dem Laden des entsprechenden Softwaremoduls |
| kiz Windows Pools (Ulm) | Ja, via Windows Start-Menü (TmoleX) |
| Uni-Ulm-weiter Lizenzzugriff | Ja, für Zugriff auf Medien bitte Softwaresupport kontaktieren (Campuslizenz) |
| Externer Lizenzzugriff | Nein, Lizenz nur für Rechner im Campusbereich |
| Softwarebezug Studierende | Nein, Lizenz nur für Rechner im Campusbereich |
| Softwarebezug Mitarbeiter | Ja, für Zugriff auf Medien bitte Softwaresupport kontaktieren (Campuslizenz) |
Nutzungsbedingungen und Lizenzvereinbarungen
Das Programmpaket Turbomole darf von allen Mitgliedern der Universität Ulm und von allen Nutzern mit Account auf den oben genannten Clustern oder Pools genutzt werden.
Turbomole darf auf alle Rechner, die sich im Netz der Universität Ulm befinden (134.60.*.*) und einem Institut angehören, installiert werden. Bitte kontaktieren Sie den Softwaresupport (siehe unten), wenn Sie Zugriff auf Turbomole-Installationsmedien benötigen.
Bitte beachten Sie, dass Turbomole nur für Forschung und Lehre eingesetzt werden darf und keinesfalls für kommerzielle Zwecke.
Bitte zitieren Sie in Ihren Veröffentlichungen Turbomole gemäß der Vorgaben, die Sie in der Programmdokumentation finden.
Uniweiter Lizenzzugriff und Softwarebezug
Wenn Sie die Software auf den Rechnern Ihres Instituts nutzen wollen, dann kontaktieren Sie bitte den Softwaresupport (siehe unten).
Weiterführende Dokumentation
Auf den Webseiten von Turbomole finden Sie eine ausführliche Programmdokumentation zu Turbomole und TmoleX. Die entsprechenden PDF-Dokumente werden auch über die unten genannten module-Befehle bereitgestellt.
Zugriff auf Software (oben genannte Linux Cluster und Pools)
Nach dem Login auf einem der Rechner der oben genannten Cluster oder Pools können Sie mittels des Befehls
module load chem/turbomole
Zugriff auf die Default-Version des Programmpakets Turbomole erhalten. Zugriff auf die grafische Benutzeroberfläche TmoleX erhalten Sie mittels des Befehls
module load chem/tmolex
welcher auch automatisch den Zugriff auf das entsprechende Turbomole freischaltet. Alle verfügbaren Turbomole-Versionen werden von dem Befehl
module avail chem/turbomole
und alle TmoleX-Versionen von dem Befehl
module avail chem/tmolex
angezeigt. Detaillierte Hilfe und Beispiele für das Queueing-System erhalten Sie mittels der Befehle
module help chem/turbomole
und
module help chem/tmolex
Bitte lesen Sie den Modul-Hilfetext bevor Sie Turbomole oder TmoleX verwenden.
Auf den Linux Pool Computern können Sie nach dem Laden des Moduls "chem/tmolex" die grafische Benutzeroberfläche einfach durch Eingabe des Befehls
TmoleX
starten. In der Abbildung sehen Sie den ersten Schritt bei der Erstellung eines Quantenchemie-Jobs - mittels des 3D-Moleküleditors wird eine Molekülstruktur erstellt.
Wenn Sie sich remote per ssh auf einem der Cluster eingeloggt haben und TmoleX verwenden wollen, dann müssen Sie entweder per X-Forwarding einloggen sein (langsam) oder eine Remote-Desktop-Anwendung wie etwa VNC verwenden (schnell).
Zugriff auf Software (Windows-Pools)
Auf den Windows Pool Computern können Sie TmoleX (mit integriertem Turbomole) über das Windows Start-Menü aufrufen.
Support
Bitte wenden Sie sich an unseren Softwaresupport, wenn Sie weitergehende Hilfe benötigen.